Az elkövetők által a leggyakrabban alkalmazott módszerek közé tartozik a váll feletti kémlelés, hogy így lessék ki a PIN-kódot, valamint az úgynevezett skimming eljárás. Ennél egy egyszerû kamerát szerelnek fel a bankautomata közvetlen közelében, valamint egy az eredetire nagyon hasonlító billentyûzetet alkalmaznak. De az is előfordul, hogy az egész bankautomatát lemásolják és ezt a készüléket állítják fel egy új helyen. Az ENISA tudomása szerint 2008-ban egész Európában összesen 10 300 skimming-esetet követtek el. A valódi esetek száma azonban ennél jóval több is lehet.
Szintén gyakori módszer, hogy a bankkártyát lemásolják, vagy ha az az automatában marad később a szerelőnek álcázott bûnözők veszik ki. Sőt, képesek arra is, hogy a függőben maradt tranzakciókat befejezzék és így vegyenek fel különböző összegeket. Végül, de egyáltalán nem utolsósorban a szervezett bandák előszeretettel törik fel a bankok és más pénzintézetek számítógépes rendszereit, valamint honlapjait és onnan szerzik meg az ügyfelek PIN-kódjait és folyószámla-adatait.
A hazánkban is népszerû bankautomata-lopások száma szintén nőtt. Ilyenkor egyszerûen kiszakítják a helyéről a berendezést, robbanóanyaggal feltörik a borítást, de gyakran használnak körfûrészeket és fúrógépeket is. "Az ATM-ek vonzó célpontok a bûnözők számára, mivel banki adatokat tartalmaznak, a bankkártyákkal ugyanakkor hozzáférhetnek az ügyfelek folyószámláihoz. Az első védelmi vonalat az jelentheti, hogy az emberek egyszerû elővigyázatossági intézkedéseket hoznak, például megpróbálják elrejteni a PIN-kódjuk bevitelét. Túl sokáig a technikai megoldásokban bíztunk, hogy így maximalizáljuk a védelmet, pedig a legtöbb bûncselekmény az emberek hibáinak kihasználásán alapul" - jegyezte meg Andrea Pirotti, az ENISA igazgatója.
Az ENISA munkatársai azt ajánlják, hogy célszerû nem közvetlenül a bankautomatákhoz menni és a bankoknak a készülékeket mindig jól megvilágított helyen kell(ene) elhelyezniük. Nem árt arra is odafigyelni, hogy nincsenek-e gyanús kiegészítők elhelyezve az automata mellett. Az online banki tranzakcióknál pedig alapvető egy rendszeresen frissített biztonsági program használata. A bûnözők leleményességére jellemző példa, hogy 2006-ban egy olyan férfit ítéltek börtönre, aki MP3-lejátszóval törte fel az ATM-eket.