Az Oracle adatbázis-technológiájára alapuló Trace Archive a világ tudományos közössége által felkutatott és közreadott összes génszekvencia gyûjteménye, amely tartalmazza a génkutatásban vezető Sanger intézet saját, hatalmas mennyiségû kutatási eredményeit is. A Cambridge határában található kutatási központ 850 alkalmazottat foglalkoztat, akik gigantikus mennyiségû adatot kezelnek.

Az archívumban tárolt adatok mennyiségéről tán mond valamit,ha egyetlen szövegsorban lennének leírva, az 250-szer körbeérné a Földet. Ha e szöveget A4-es papírlapokra nyomtatnák, a lapok kötegei két és félszer magasabbra tornyosulnának, mint a Mount Everest. Az archívum 22 terabájt nagyságú, és mérete minden hónapban megduplázódik: ez valószínûleg Európa, vagy talán a világ legnagyobb tudományos adatbázisa. Összehasonlításképpen: a British Library 13 millió tételt tartalmaz, az amerikai kongresszusi könyvtár 115 milliót, míg a Trace Archive egymilliárd különálló információs egységet tárol.

Az egyes genetikai adatrekordok átlagosan 864 karakter hosszúságúak. A tudósok a génszekvenciák között kereshetnek, és egymáshoz illeszthetik azokat a különböző élőlények (egerek, halak, legyek, baktériumok és persze az ember) teljes géntérképének összeállításához. Az adatok a világ bármely pontjáról korlátozás nélkül hozzáférhetők a génkutatók és szakemberek számára, akik egy adott betegség vagy gén tanulmányozása során könnyen letölthetik az adott területhez kapcsolódó már feltárt genetikai információt. Az egészség és a betegségek biológiai hátterét tanulmányozó tudományos és kereskedelmi szervezetek orvosbiológus kutatói aktívan használják ezeket az adatokat.

Martin Widlake, a Wellcome Trust Sanger intézet adatbázis-szolgáltatásokért felelős igazgatója elmondta, hogy: „A Trace Archive 22 ezer gigabájtos méretével a világ tíz legnagyobb UNIX-adatbázisa között van. Az adathalmaz növekedésével egyre nagyobb problémát jelent az adatok elérése. Az egész adatbázisból egy adott génszekvenciát előkeresni olyan, mintha egyetlen mondatot keresnénk a British Library anyagában, ami meglehetősen munkaigényes feladat. A Sanger intézet csapata mindamellett olyan új módszereken dolgozik, amelyek könnyebbé teszik az adatok keresését és elérését.”

Ezt a hatalmas mennyiségû adatot egy Oracle Database 10g adatbázis kezeli. A feldolgozott adatokat négy HP ES45 szerverből álló számítógép fürt tölti fel az adatbázisba. A Winter Corporation 2005-ös, adatbázisokról készült felmérése szerint (amely a világ legnagyobb adatbázisait sorolja fel) a Trace Archive az ötödik helyezést éri el olyan óriások mögött, mint az AT&T, a Yahoo és egyéb globális vállalatok.

(hvg.hu)